ネット上のコミュニティや知恵袋などで頻繁に見られるのが、「ばいきんまんとドキンちゃんは夫婦や兄妹なのか？」「コキンちゃんを含めた3人は家族なのか？」という疑問です。
これも公式設定では明確に否定されています。ばいきんまんとドキンちゃんは「仲間であり居候関係」であり、恋愛関係でも夫婦でもありません（ドキンちゃんの本命は一貫してしょくぱんまん）。
バイキン星出身のキャラクターたちは、地球の一般的な「戸籍上の家族」という概念とは異なり、同郷の絆や個々のリスペクトによって結びついています。コキンちゃんがバイキン城へふらりとやって来ては去っていくのも、束縛を嫌うバイキン星の種族的な気質が反映された設定です。
したがって、「家族ではないからこそ成立する、絶妙な距離感のシスターフッド（女性同士の連帯）」として描かれている点を見落としてはなりません。
