京都橘中学校における教育の主軸となるのが、中高一貫教育を担う「Vコース」です。高校からの入学者とは異なるカリキュラムで先取り学習を進め、高校段階では難関国公立大学や難関私立大学を目指す特別進学クラスへと接続します。
近年の大学合格状況・進学実績において特筆すべきは、系列校である京都橘大学への内部推薦枠を安全網（セーフティネット）として保持しながら、国公立大学（京都大・大阪大・神戸大・京都府立大など）や関関同立（同志社・立命館・関西・関西学院）、産近甲龍への外部受験に果敢にチャレンジできる環境が確立されている点です。
かつては「部活動中心の学校」というパブリックイメージが先行していましたが、現在のVコースでは徹底したICT活用と定期的な習熟度別指導により、「国公立・難関私大合格者のうち中高一貫生が占める割合」が着実に向上しています。部活動で培った集中力と粘り強さを受験勉強へと転換させる指導ノウハウが機能していることが、進学実績の底上げにつながっています。
