アイ愛センターの目玉設備の一つが、一年を通じて快適に泳げる温水プールです。25メートルコースに加えてスロープ付きの歩行プールが併設されており、車いすからの入水移乗台やリフトなど、障がい者やシニア層に配慮した入水サポート設備が整っています。
アイ愛センターのプール利用にあたっては、水泳帽(スイムキャップ)の着用が必須です。また、安全管理のため、特定の時間帯には障がい者専用コースや指導員付きの水中運動教室が実施されていることがあります。一般自由遊泳を目的とする場合は、公式の「プール予定表」を事前確認し、一般開放枠に合わせて来館するのが賢い利用法です。