熱狂的な盛り上がりを見せる一方で、NL相性診断をめぐる取り扱いには見落とされがちな注意点が存在します。
最も多い誤解は、「診断結果が公式カップリングの将来を縛る・決定づける」と思い込んでしまうケースです。原作者や公式メディアが提示する物語の文脈とは無関係な第三者作成のアルゴリズムであるにもかかわらず、SNS上で「相性が悪いからこのカプは公式になれない」といった極端な言説を展開し、ファン同士の摩擦を生んでしまう事例が散見されます。
また、プライベートな実名や鍵アカウント限定の情報を安易に公開型診断に入力することで生じるセキュリティリスクも無視できません。特にソーシャルログインを要求するタイプの外部診断サービスでは、アカウント連携時のパーミッション（権限付与）を慎重に確認することが求められます。
