訪問を検討する際に最も注意すべきなのが、座席の確保手順です。特に週末や長期休暇シーズンは、竹下通りの混雑も相まって入店ハードルが急上昇します。快適に利用するためには、公式予約システムと当日受付の仕組みを正確に把握しておく必要があります。
予約は基本的に公式サイト経由のオンライン予約システムを利用します。毎月指定の日時（通常は翌月分の枠が前月下旬に開放）に受付が開始されますが、土日祝日のランチタイム（12:00〜14:00）やカフェタイム（14:30〜16:30）は、受付開始直後に満席となるケースが珍しくありません。キャンセル枠の再放出も随時行われるため、こまめな空席照会が有効なアプローチとなります。
一方で、「予約が取れなかった」「急に原宿へ行くことになった」という場合でも諦める必要はありません。ポムポムプリンカフェ原宿店では、一定割合の「当日席」が確保されています。ただし、店頭でそのまま並ぶのではなく、開店直後から店頭のタッチパネル端末でデジタル整理券（QRコード付き発券）を取得するシステムが定着しています。休日は午前11時の開店から1時間足らずで夕方までの整理券が配り切られることもあるため、確実に当日席を勝ち取るなら午前10時30分前後の現地到着が必須ラインと言えます。
