秋葉原駅はJR各線だけでなく、東京メトロ日比谷線や首都圏新都市鉄道（つくばエクスプレス）が乗り入れる結節点です。しかし、電気街口改札は西側に位置しているのに対し、地下鉄やTXは東側に位置しているため、乗り換え動線には工夫が求められます。
電気街口改札から東京メトロ日比谷線へ向かう場合、改札を出て右手の「東西自由通路」を通り、中央改札・昭和通り口方面へ抜けるルートが最短です。所要時間は徒歩で約5〜7分程度。地上の信号待ちを回避してスムーズに移動できます。
つくばエクスプレス（TX）への乗り換えも同様に、東西自由通路を経由して「TX中央改札」へ地下エスカレーターで下るルートが最適です。こちらは徒歩約4〜6分でアクセス可能です。乗り換え時間に余裕がない場合は、JR線ホームから最初から中央改札を目指して下車する方が移動距離を短縮できます。
