仁淀川の水がなぜあれほどまでに鮮やかな青を湛えているのか。その理由は単なる偶然ではなく、四国山地の大自然がもたらす極めて緻密な科学的・地形的要因によって説明されます。
第1の要因は、光の波長と水分子による「レイリー散乱」です。水分子は太陽光のうち波長の長い「赤色」の光を吸収し、波長の短い「青色」の光だけを強く散乱・反射する性質を持っています。不純物やプランクトンが極端に少ない純度の高い水ほど、この散乱現象が純粋に発現し、人間の目に鮮烈な青として映り込みます。
第2に、流域の地質と砂利の少なさが挙げられます。仁淀川の上流部は硬い変成岩（緑色片岩など）の岩盤で形成されており、泥や粘土質の微粒子が水中に溶け出しにくい環境にあります。さらに河床に堆積する岩や砂利が青緑色を帯びているため、水底からの照り返しが水の色味を一層引き立てます。
第3は、急峻な地形と豊富な水量による自浄作用です。西日本最高峰の霊峰・石鎚山系から太平洋へと一気に駆け下りる急勾配が、水流の淀みを防ぎ、藻類の過剰な発生を抑制し続けます。関係機関の水質調査データでも、有機汚濁の指標であるBOD（生物化学的酸素要求量）値が年間を通じて0.5〜0.7mg/L前後の極めて低い水準を保っており、国内最高峰の清澄度を裏付けています。
