お祭りの最大の楽しみの一つが、軒を連ねる屋台巡りです。琴似神社お祭り屋台出店時間は、両日とも概ね午前10:00頃から夜21:00頃まで営業を行っています。ただし、初日の9月3日は各店舗の準備状況によって午前中は一部店舗のみの営業となり、本格的に全店が稼働するのは昼前(11:30前後)からとなるケースが一般的です。
露店が並ぶメインの琴似本通露店場所は、地下鉄東西線琴似駅近くの交差点から琴似神社周辺に至る歩道沿い、ならびに神社境内エリアです。出店数は合計で150店〜200店規模に達し、定番の焼きそば・たこ焼き・りんご飴はもちろん、北海道ならではのホタテ焼きやザンギ、若年層に人気のトレンドスイーツまで多彩な琴似神社秋祭り出店店舗が揃います。