アパホテル巣鴨駅前の象徴とも言える設備が、最上階14階に位置する準天然光明石温泉（人工温泉）大浴場「玄要の湯」です。厚生労働省承認の医薬部外品である「光明石」を採用したお湯は、神経痛や疲労回復に効果が期待できるとされ、都心のホテルにいながら本格的な湯浴み体験を味わえます。
大浴場には広々とした内湯に加えて開放的な露天風呂が併設されており、最上階ならではの心地よい外気を感じながらリラックスすることが可能です。利用時間は午後3時から深夜2時まで、および翌朝6時から10時までとなっており、遅い時間のチェックインや早朝の出発前でも柔軟に入浴できるスケジュールが組まれています。
客室設備やアメニティの品質にも妥協がありません。独自開発のオリジナルベッド「Cloud fit（クラウドフィット）」は雲の上に浮いているような快眠環境を提供し、通常の約3倍の極細毛を採用したハブラシや、環境に配慮した高品質シャンプー類、たまご型浴槽など、細部にまで計算し尽くされた機能性が宿泊者のストレスを軽減します。
