岡山理科大学附属高校を受験する上でまず理解すべきなのは、単一の偏差値では学校全体を測れない「マルチトラック型のコース構造」です。普通科の中に学力層や将来目標に合わせた複数の専門コースが設置されており、入試難易度や求められる学力水準は大きく異なります。
大手模試データおよび高校受験動向によると、国公立大学や難関私大現役合格を目指す「特別進学コース」や、世界標準のディプロマプログラムを提供する「国際バカロレア（IB）コース」の岡山理大附属高校の偏差値は58〜62前後に位置します。これに対して、理大の系列学部進学や基礎学力定着を重視する進学系コースや生命動物コース、スポーツサイエンスコースは偏差値42〜50前後となっており、同一校内に幅広い学力層が共存しています。
入試選抜における合格最低点や選定基準について、特別進学コースでは3教科または5教科の学科学力試験で7割以上の得点率が安全圏とされますが、専願入試や各種特待生選抜では内申点や面接、実技実績が重視されます。一方、系列の岡山理科大学附属中学校から進学する中高一貫生は、早期カリキュラムによる先取り学習を進めており、高校からの外部入学生とはクラス編成や学習ペースが綿密に区分けされています。
