淵神社駅へのアクセスは、事前に選択肢を把握しておくことがスムーズな観光の肝となる。長崎駅から路線バスを利用する場合、「ロープウェイ前」バス停で下車すれば徒歩約2分で到着する。タクシーを使えば長崎駅前から10分程度と、移動の負担は極めて少ない。
マイカーやレンタカーで訪れる旅行者に向けて、淵神社境内には無料の参拝・利用者用駐車場が備わっている。ただし、収容台数は十数台程度に限られており、夕刻のピーク時にはあっという間に満車となる。車で向かう場合は、近隣のコインパーキングの位置をあらかじめ確認しておくか、長崎市内主要ホテルと駅を結ぶ無料循環バスの活用を強く推奨したい。