水明館での滞在満足度を左右する最大の分岐点は、間違いなく「宿泊する棟の選択」にある。水明館は主に「山水閣」「飛泉閣」「高山閣」、そして最高級棟である「臨川閣」といった複数の客室棟で構成されているが、それぞれの性格と設備水準は大きく異なる。
最高峰に位置する「臨川閣」は、部屋タイプごとに高品位な飛騨の木材がふんだんに使用され、全室に温泉引き込みの室内風呂が完備された贅沢な造りとなっている。洗練された調度品と行き届いた仲居のおもてなしが提供される臨川閣の利用客からは、高級温泉旅館としての格調の高さを称賛する声が圧倒的に多い。
一方で、リーズナブルな価格帯で提供されている旧館やスタンダードなお部屋に滞在した利用客からは、設備の年式や防音性の低さに対する不満が噴出しやすい。つまり、水明館を訪れる際は「老舗高級旅館の真髄」をどの客室で体験するかを慎重に見極める必要があり、予算に応じた棟選びこそが後悔を防ぐ鍵となる。