くじらの博物館の真髄は、生体展示だけにとどまりません。エントランスを抜けた先にある本館は、太地町が400年以上にわたって育んできた捕鯨の歴史と学術データを凝縮した世界最大級の鯨類専門ミュージアムです。
吹き抜けの大ホールに足を踏み入れると、天井から吊り下げられた体長十数メートルに及ぶセミクジラの実物大模型や、マッコウクジラ、シャチなどの巨大骨格標本が圧倒的な威圧感で出迎えます。太地町は江戸時代初期に「網捕り式捕鯨法」を考案し、日本の捕鯨技術を飛躍的に発展させた発祥の地。展示フロアには、当時命がけで海へ繰り出した男たちの様子を伝える古文書、捕鯨銃、伝統的な勢子舟（せこぶね）の模型、精緻なジオラマが並びます。
単なる「狩猟の歴史」にとどまらず、鯨の肉を食し、骨や油を余すことなく工芸品や生活資材へと活用した「一頭余すところなく使い切る」という日本古来の資源利用思想と自然への敬意が、膨大な一次資料から浮き彫りになります。海洋生物学と民俗学の両面から鯨を深く掘り下げた展示構成は、知的好奇心を刺激して止みません。
