TOHOシネマズ新宿の体験価値を大きく左右するのが「座席選び」です。全12スクリーンのうち、フラッグシップとなるスクリーン9（TCX・499席）やスクリーン10（IMAX・311席）などの大型シアターから、100席前後の小規模スクリーンまで構造が大きく異なります。
映画ファンの鑑賞ログや現場での視界検証から導き出された、失敗しない座席ポジションの目安は以下の通りです。
まず、スクリーン9やスクリーン10といった大規模シアターでは、前方のA〜D列は視界全体に映像が広がるものの、見上げる角度がきつく首への負担が大きくなります。視野全体に自然にスクリーンが収まり、サラウンド音響のスイートスポットとなるのは「G列〜I列の中央ブロック（15〜22番付近）」です。没入感を最優先したい場合はE〜F列、スクリーン全体を俯瞰してゆったり観たい場合はJ〜K列が推奨されます。
また、長時間鑑賞で圧倒的な快適性をもたらすのが、スクリーン9などに導入されているプレミアムボックスシート（通常鑑賞料金＋1,000円）です。セミプライベートな空間を仕切るパーテーション、高級レザーシート、重厚な木目調の専用テーブル、荷物置きスペースが完備されており、「隣の観客のポップコーンを食べる音や身動きが全く気にならない」「映画への集中度が段違い」と映画通からも極めて高い評価を得ています。
