科学的な解明が進むはるか昔から、この現象は信仰の対象として大切に守り継がれてきた。諏訪大社の上社本宮に鎮座する男神・建御名方神（たけみなかたのかみ）が、下社秋宮にいる女神・八坂刀売神（やさかとめのせのかみ）のもとへ湖を渡って逢瀬に通う道筋――それが御神渡りの名の由来である。
長野県諏訪市小和田に鎮座する八剣神社には、室町時代初期の1440年代から約600年間にわたり途切れることなく書き継がれてきた「御渡り帳」が存在する。神職と氏子総代たちが湖畔に立ち、氷の亀裂の方向や状態を検分する「拝観式」を経て、その年の世相や作況を占う神事は、今も昔も変わらぬ厳格さで執り行われている。この古文書群は、世界的に見ても類例のない極めて連続性の高い気候変動の一次資料として、気候学者たちからも熱い視線を注がれている。
